Hygiena a kontrola kontaminace mají klíčový význam v každé fázi moderní linky pro plnění vody, protože voda je produkt s nízkou kyselostí, který je náchylný k mikrobiálnímu růstu. Celá linka pro plnění vody je vyrobena z potravinářské nerezové oceli (AISI 304/316L) pro všechny povrchy, které přicházejí do kontaktu s produktem; tyto povrchy jsou leštěny na hladký povrch, aby se zabránilo přilnavosti bakterií. Klíčovou funkcí je integrovaný uzavřený systém čištění bez demontáže (CIP), který automaticky čistí a dezinfikuje nádrže, potrubí a plnicí ventily linky pro plnění vody bez nutnosti jejich rozebírání. Oplachovací stroj na začátku linky pro plnění vody používá filtrovaný stlačený vzduch, ozonem obohacenou vodu nebo čistou vodu, aby byla zajištěna vnitřní čistota každé lahve před plněním. U výrobců sterilní balené vody je do linky pro plnění vody začleněna sterilní zóna s laminárním prouděním vzduchu filtrujícím přes HEPA filtry kolem plnicích ventilů a všechny součásti jsou před uvedením do provozu sterilizovány přehřátou párou nebo chemickými výpary. Tato komplexní pozornost věnovaná hygienickému návrhu zajišťuje, že každá láhev vyrobená na lince pro plnění vody splňuje nejvyšší světové normy potravinářské bezpečnosti a chrání tak zdraví spotřebitelů i pověst značky.