Zavedení přísného, vědecky podloženého programu zajištění kvality (QA) je základem důvěry spotřebitelů a pověsti značky pro jakoukoli továrnu na balení vody. Tento program v profesionální továrně na balení vody sahá daleko za koneční kontrolu produktu a zahrnuje celý výrobní proces. Patří sem pravidelné mikrobiologické a chemické testování vody ze zdroje, vody během výroby po každé fázi úpravy a hotových lahví. Továrna na balení vody musí také ověřit účinnost postupů čištění a dezinfekce (CIP) a sledovat hygienu výrobního prostředí prostřednictvím testů vzorků z ovzduší a povrchů (swab testy). Podrobné vedení záznamů a systémy sledovatelnosti jsou povinné, aby bylo možné každou šarži vyrobenou v továrně na balení vody dovést zpět ke zdrojovým materiálům a podmínkám výroby. Dodržování mezinárodních norem, jako je HACCP (analýza rizik a kritické body řízení), je standardní praxí u renomované továrny na balení vody a zajišťuje proaktivní, preventivní přístup ke správě potravinové bezpečnosti.