تُعَدّ قاعة التغليف والإنتاج القلب النابض لمصنع تعبئة المياه، حيث تُملأ المياه المعالَجة في الحاويات. وتضم هذه المنطقة من مصنع تعبئة المياه خطوط الإنتاج الآلية، والتي قد تشمل آلة نفخ الزجاجات (إذا كانت الزجاجات تُصنَّع في الموقع)، وآلات شطف الزجاجات، وآلة التعبئة، وآلات الغلق، وآلات وضع الملصقات، وآلات الترميز، ومعدات التغليف مثل آلات التغليف بالانكماش أو آلات تجميع العلب. وقد صُمِّمت تخطيطات هذه القاعة في مصنع تعبئة المياه بحيث تحقِّق تدفقًا سلسًا وخطيًّا للمواد، بهدف تقليل الاختناقات المرورية ومخاطر التلوث المتبادل. كما أن التحكم في البيئة يكتسي أهميةً بالغة في هذه المنطقة؛ إذ يُعدّ الحفاظ على ضغط هواء إيجابي، ودرجة حرارة خاضعة للرقابة، ومستويات عالية من النظافة في منطقة الإنتاج التابعة لمصنع تعبئة المياه أمرًا جوهريًّا لسلامة المنتج ولتشغيل المعدات الكهروميكانيكية الحساسة بشكلٍ موثوق. وبذلك فإن كفاءة هذه المنطقة بأكملها تُحدِّدُ بشكلٍ مباشرٍ الإنتاج الكلي وتكاليف التشغيل لمصنع تعبئة المياه.