การติดตั้งอย่างเหมาะสมและการบำรุงรักษาอย่างสม่ำเสมอเป็นสิ่งพื้นฐานสำคัญที่จะทำให้เครื่องบรรจุขวดน้ำสามารถทำงานได้เต็มศักยภาพและมีอายุการใช้งานยาวนาน การติดตั้งโดยวิศวกรของผู้จัดจำหน่ายอย่างมืออาชีพจะรับประกันว่าเครื่องจะถูกตั้งระดับให้เรียบสนิท จัดแนวให้สอดคล้องกับระบบลำเลียง และเชื่อมต่อกับแหล่งพลังงานทั้งหมดได้อย่างถูกต้อง การฝึกอบรมผู้ปฏิบัติงานอย่างครอบคลุมเป็นสิ่งจำเป็น โดยครอบคลุมขั้นตอนการปฏิบัติงานประจำวัน ขั้นตอนการทำความสะอาด และการแก้ไขปัญหาพื้นฐาน แผนการบำรุงรักษาเชิงป้องกันสำหรับเครื่องบรรจุขวดน้ำ—ซึ่งรวมถึงการหล่อลื่นอย่างสม่ำเสมอ การตรวจสอบซีลและแหวนรองรับ (gaskets) การปรับค่าการวัดปริมาตรการบรรจุ (calibration of fill volume) และการทำความสะอาดเซนเซอร์—จะช่วยป้องกันไม่ให้ปัญหาเล็กน้อยลุกลามกลายเป็นความล้มเหลวครั้งใหญ่ การปฏิบัติตามแนวทางการบำรุงรักษาของผู้ผลิตอย่างเคร่งครัดจะช่วยเพิ่มเวลาในการทำงาน (uptime) สูงสุด รับประกันคุณภาพผลิตภัณฑ์ที่สม่ำเสมอ และคุ้มครองเครื่องบรรจุขวดน้ำในฐานะทรัพย์สินที่มีค่าในระยะยาวภายในโรงงานการผลิต